MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-031

Total Repeats: 67466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021837	ATA	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021837	CGC	2	6	61	66	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021837	CAAC	2	8	81	88	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021837	ACC	2	6	169	174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021837	ATA	2	6	230	235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021837	TCC	2	6	287	292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021837	TTC	2	6	344	349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021837	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021837	CTG	2	6	379	384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021837	TTG	2	6	550	555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021837	CAT	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021837	TTA	2	6	639	644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021837	CAAAA	2	10	700	709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021837	A	7	7	706	712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021837	TAT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525916940
16	NC_021837	AATA	2	8	762	769	75 %	25 %	0 %	0 %	525916940
17	NC_021837	CAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916940
18	NC_021837	CTG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916940
19	NC_021837	TTG	2	6	948	953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916940
20	NC_021837	GGC	2	6	994	999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525916940
21	NC_021837	GTTT	2	8	1014	1021	0 %	75 %	25 %	0 %	525916940
22	NC_021837	CAT	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916940
23	NC_021837	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916940
24	NC_021837	CACCC	2	10	1221	1230	20 %	0 %	0 %	80 %	525916940
25	NC_021837	TGC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916940
26	NC_021837	GTA	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916940
27	NC_021837	ATC	2	6	1300	1305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916940
28	NC_021837	ATC	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916940
29	NC_021837	CAAA	2	8	1417	1424	75 %	0 %	0 %	25 %	525916940
30	NC_021837	CCA	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916940
31	NC_021837	ACT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916940
32	NC_021837	CCA	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525916940
33	NC_021837	AAT	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916940
34	NC_021837	AAC	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916940
35	NC_021837	AAT	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916940
36	NC_021837	AAT	2	6	1620	1625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916940
37	NC_021837	CAAGT	2	10	1660	1669	40 %	20 %	20 %	20 %	525916940
38	NC_021837	TCG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916940
39	NC_021837	CTG	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916940
40	NC_021837	ATC	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916940
41	NC_021837	GTA	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916940
42	NC_021837	CTG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916940
43	NC_021837	A	6	6	1911	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	525916940
44	NC_021837	CACTG	2	10	2002	2011	20 %	20 %	20 %	40 %	525916940
45	NC_021837	AATCA	2	10	2037	2046	60 %	20 %	0 %	20 %	525916940
46	NC_021837	AAT	2	6	2112	2117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916940
47	NC_021837	CTT	2	6	2150	2155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916940
48	NC_021837	AGT	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021837	GCTAT	2	10	2271	2280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021837	T	6	6	2303	2308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021837	ATTT	2	8	2323	2330	25 %	75 %	0 %	0 %	525916941
52	NC_021837	TA	3	6	2360	2365	50 %	50 %	0 %	0 %	525916941
53	NC_021837	ACT	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916941
54	NC_021837	TG	3	6	2506	2511	0 %	50 %	50 %	0 %	525916941
55	NC_021837	TG	3	6	2570	2575	0 %	50 %	50 %	0 %	525916941
56	NC_021837	GGC	2	6	2581	2586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525916941
57	NC_021837	CTT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916941
58	NC_021837	CGG	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525916941
59	NC_021837	GTTG	2	8	2653	2660	0 %	50 %	50 %	0 %	525916941
60	NC_021837	TTG	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916941
61	NC_021837	AAATT	2	10	2725	2734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021837	CAAA	2	8	2742	2749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021837	TCCA	2	8	2800	2807	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021837	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021837	GAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
66	NC_021837	TTG	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525916942
67	NC_021837	A	6	6	3042	3047	100 %	0 %	0 %	0 %	525916942
68	NC_021837	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
69	NC_021837	GTA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916942
70	NC_021837	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
71	NC_021837	CTG	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916942
72	NC_021837	GAAA	2	8	3275	3282	75 %	0 %	25 %	0 %	525916942
73	NC_021837	CTG	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916942
74	NC_021837	AAG	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
75	NC_021837	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
76	NC_021837	TC	4	8	3431	3438	0 %	50 %	0 %	50 %	525916942
77	NC_021837	AGC	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916942
78	NC_021837	AAG	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
79	NC_021837	CTG	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916942
80	NC_021837	AAG	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916942
81	NC_021837	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	525916942
82	NC_021837	CTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916942
83	NC_021837	CTGC	2	8	3660	3667	0 %	25 %	25 %	50 %	525916942
84	NC_021837	TAAA	2	8	3767	3774	75 %	25 %	0 %	0 %	525916942
85	NC_021837	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021837	TTC	2	6	3840	3845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021837	GGA	2	6	3881	3886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021837	GAA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916943
89	NC_021837	TTA	3	9	3913	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525916943
90	NC_021837	CTA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916943
91	NC_021837	A	7	7	4014	4020	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
92	NC_021837	TCA	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916943
93	NC_021837	AATT	2	8	4123	4130	50 %	50 %	0 %	0 %	525916943
94	NC_021837	A	7	7	4156	4162	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
95	NC_021837	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
96	NC_021837	A	6	6	4303	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
97	NC_021837	GCCGCA	2	12	4332	4343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525916943
98	NC_021837	CAA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916943
99	NC_021837	GAAA	2	8	4361	4368	75 %	0 %	25 %	0 %	525916943
100	NC_021837	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
101	NC_021837	AAT	2	6	4473	4478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916943
102	NC_021837	CCTT	2	8	4499	4506	0 %	50 %	0 %	50 %	525916943
103	NC_021837	TGA	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916943
104	NC_021837	CAA	2	6	4561	4566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916943
105	NC_021837	A	6	6	4578	4583	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
106	NC_021837	AGCG	2	8	4625	4632	25 %	0 %	50 %	25 %	525916943
107	NC_021837	AGC	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525916943
108	NC_021837	AAT	2	6	4719	4724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916943
109	NC_021837	AAC	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916943
110	NC_021837	AGAA	2	8	4832	4839	75 %	0 %	25 %	0 %	525916943
111	NC_021837	GAA	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916943
112	NC_021837	A	6	6	4863	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
113	NC_021837	TCGTTA	2	12	4879	4890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916943
114	NC_021837	CTCACC	2	12	4990	5001	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525916943
115	NC_021837	AGA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916943
116	NC_021837	TAA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916943
117	NC_021837	GTA	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916943
118	NC_021837	GAT	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916943
119	NC_021837	A	7	7	5241	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	525916943
120	NC_021837	TGAAC	2	10	5255	5264	40 %	20 %	20 %	20 %	525916943
121	NC_021837	GGC	2	6	5286	5291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525916943
122	NC_021837	ACTT	2	8	5304	5311	25 %	50 %	0 %	25 %	525916943
123	NC_021837	ATA	2	6	5324	5329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916943
124	NC_021837	TCT	2	6	5343	5348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021837	T	7	7	5366	5372	0 %	100 %	0 %	0 %	525916944
126	NC_021837	ATA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916944
127	NC_021837	AAG	2	6	5415	5420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525916944
128	NC_021837	AAT	2	6	5473	5478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525916944
129	NC_021837	CTG	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525916944
130	NC_021837	CAA	2	6	5541	5546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525916944
131	NC_021837	TAGTTC	2	12	5611	5622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525916944
132	NC_021837	TCT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525916944
133	NC_021837	CAT	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916944
134	NC_021837	GAT	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525916944
135	NC_021837	CAT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525916944
136	NC_021837	CCT	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021837	ATTC	2	8	5870	5877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021837	AAT	2	6	5897	5902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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